腦膜炎都可以出現頭痛、嘔吐以及頸項強直為主要表現的腦膜刺激征。病毒性腦炎和結腦的鑒別主要是通過臨床癥狀、體征及實驗室檢查來鑒別。
第一，臨床癥狀和體征。病毒性腦膜炎病前往往有感冒、腹瀉等病史，隨后出現頭痛、倦怠、嘔吐、精神障礙后可以出現昏迷，有彌漫性的腦受損體征。而結核性腦膜炎的臨床癥狀體征，起病往往比較緩慢，常有結核病史還有低熱、神志模糊、頭痛、嘔吐、后期可有昏迷，腦膜刺激癥是陽性的。
第二，實驗室檢查的結果：
1，抽血化驗病毒性腦膜炎的血常規，白細胞都是正常的。而結核性腦膜炎，白細胞都有升高，并且中性粒細胞以淋巴細胞升高為主。
2，腦脊液的檢查。病毒性腦膜炎腦脊液壓力是升高的，外觀是微混，看上去有膜樣物。腦脊液蛋白是增加，細胞少量增加，增加是以淋巴細胞為主。腦脊液含量是正常的，氯化物含量也是正常的。而結核性腦膜炎的腦脊液壓力是增高的，外觀呈毛玻璃狀，蛋白也是增加的。細胞數稍增高，都是以淋巴細胞為主，糖是下降的，氯化物也是明顯下降的。
最后結核性腦膜炎可以涂片檢查和培養可以找到結核桿菌。
另外，病毒性腦膜炎病程往往呈自限性，預后跟有沒有積極的對癥支持治療有很大關系。而結核性腦膜炎必須通過抗結核治療才能改善患者預后。
