百令膠囊在臨床上主要是發酵的冬蟲夏草菌粉制成的膠囊制劑，主治的功能是補肺腎、益精氣，因此它特別適用于中醫診斷為肺腎兩虛引起的咳嗽、氣喘、咳血、腰背酸痛這些對癥治療。
其次它也可以用于西醫的慢性支氣管炎、慢性肝炎、癌癥、自身免疫疾病、慢性腎炎和器官移植等患者的治療和輔助治療。因為它的一些現代藥理學研究發現它對腎臟疾病，尤其是慢性腎炎、蛋白尿治療率的比較高。而且在一些免疫治療的基礎上加用百令膠囊，對于一些慢性腎移植的患者，可以減少患者的蛋白尿的排出。
其次在呼吸系統方面，百令膠囊也是有很好的效果。在呼吸系統如果同時口服，加抗生素的治療的話，在社區獲得性肺炎合并二型糖尿病的患者，大部分患者的癥狀體征輔助檢查，它是明顯優于單純使用抗生素的。
其次輔助治療腫瘤方面，它可以治療胃腸道的惡性腫瘤，經過一些化療手術治療以后，出現氣陰兩虛的證候或者是免疫功能低下的患者，也是可以取到一些比較較好的療效。
其次在肝臟疾病在常規的基礎治療基礎上，加用百令膠囊它可以治療病毒性肝炎，較前后患者的血清自由基的指標相比而言，它可以增加、配合肝炎藥物治療的療效。
所以因此它在以上的一些疾病的治療中，它都有相應的一些輔助治療的功效，但是輔助治療它不可以替代治療藥物。因此在選擇藥物的時候，一定要在專業的醫生指導下進行選擇。
