卵巢囊腫分為生理性的囊腫和病理性的囊腫，生理性的囊腫大多是卵巢的黃體囊腫，在卵巢的黃體期卵巢是囊性增大的，一般的情況下經過觀察兩到三個月以，后卵巢的黃體囊腫能夠自行的消退。如果彩超檢查提示卵巢的就是囊腫囊性增大，處于卵巢的黃體期，考慮生理性囊腫是不能排除的。
如果查腫瘤標志物是正常的，而且沒有明顯的腹痛、不適等癥狀，可以動態觀察，觀察三個月以后在月經干凈以后，再到醫院復查盆腔彩超。如果彩超的檢查提示囊腫消退，考慮是生理性囊腫。如果彩超檢查提示囊腫持續存在，說明是病理性的囊腫。
對于病理性的囊腫，我們常規要做手術治療，如果根據術前的癥狀、體征、婦科檢查、輔助檢查的情況，考慮是卵巢囊腫的良性的可能性比較大，可以進行微創手術。微創手術目前首先腹腔鏡手術，腹腔鏡手術具體的手術范圍根據患者的年齡、有沒有生育要求，以及有沒有其他的癥狀來決定。
如果對于年輕女性，卵巢膿腫我們一般行卵巢囊腫的剝除術，術中根據術中的病理結果決定是不是擴大手術范圍。對于沒有生育要求的或者是已經絕經的，可以行外側的附件切除或者是雙側的附件切除，或者是全子宮以及雙側附件的切除術，術中再根據術中的冰凍決定是否擴大手術范圍。
如果術中的冰凍提示是惡性的，要行經腹的手術。如果出現診斷考慮卵巢囊腫惡性的可能性比較大，要行經腹手術，經腹手術根據術中的探查情況，確定是行卵巢惡性腫瘤的分期手術，還是行卵巢惡性腫瘤的減滅術。
