腰痛是臨床各科的常見癥狀，尿路感染病人也常出現腰痛，腎臟包膜、腎盂和輸尿管受到刺激和張力增高時均可產生疼痛。根據病因、病位、病變性質和程度的不同，臨床上可表現出各種腰痛，如鈍脹痛、劇痛、絞痛、酸痛等。尿路感染病人一般以腰酸痛，鈍脹痛、劇痛為主，伴有結石時可出現絞痛。急性尿路感染腰痛程度較重，以劇痛、鈍痛為主。慢性尿路感染則以腰酸痛常見。
一般情況下下尿路感染不引起腰痛，上尿路感染尤其是有腎積水，尿路結石，腎梗阻時絕大數有腰痛癥狀。腎臟疾病引起的腰痛有特定的壓痛部位，可與其它原因引起的腰痛鑒別：
一，十二肋與脊柱成角處。
二，十二肋與腰肌外緣成角處。
三，肋緣下腹直肌和肋骨連接外側。
四，上輸尿管點，腹直肌外緣平齊處。
五，中輸尿管點，兩髂前上棘連線與通過恥骨結節所作垂線的相交點，相當于輸尿管進入骨盆腔處。
六，下輸尿管點，中輸尿管點下肋側，相當于膀胱輸尿管處。腎臟疾病所致的腰痛常需與脊柱病變所致的腰痛相鑒別，前者除腎臟病變已波及腰肌外，疼痛與腰部活動無關，也不放射到腿部，后者常因腰部運動或體位運動，而使腰痛加劇，有時還可放射到下肢，呈坐骨神經痛的表現，可做腰椎x線拍片和其他相應的檢查以協助診斷。
