尿路感染的診斷不能單純依靠臨床癥狀和體征，而要依靠實驗室檢查，診斷還應明確致病菌感染部位，腎功能狀態等，凡是有真性細菌尿者，才能診斷為尿路感染。
真性細菌尿是指：
一、膀胱穿刺尿培養，有細菌生長，或菌落數大于十的二次方每毫升。
二、細菌定量培養大于等于十的五次方每毫升。
三、清潔中段尿定量培養大于等于十的五次方每毫升，一次準確性為80%；連續兩次培養得到同一菌落數大于等于十的五次方每毫升，準確性達95%。如中斷尿培養菌落數在十的四次方是十的五次方每毫升之間，列為可疑，應重復培養。
如為球菌中斷尿培養菌落數大于等于兩百每毫升既有診斷意義，診斷依據歸納如下:
一、癥狀性尿路感染，臨床上有尿頻、尿急及尿痛等尿路刺激癥狀，同時有下列一項指標者診斷可以成立。
1、清潔中段尿培養菌落數大于等于十的五次方每毫升。
2、清潔中斷尿精簡白細胞數大于5/HP，且涂片找到細菌者。
3、清潔中段尿ttc試驗，亞硝酸鹽試驗或常是陽性，尿白細胞大于5/HP。
二、無癥狀性菌尿，臨床上無尿路刺激癥狀。符合下列之一者才能確診：
1、連續兩次清潔中段尿培養，兩次均落數大于等于十的五次方每毫升，且為同一菌數。
2、一次清潔中段尿培養菌落數大于等于十的五次方每毫升，尿白細胞大于5/HP。
3、恥骨上膀胱穿刺尿，培養有致病菌生長和菌落數大于一百毫升。
