肛旁膿腫應該去肛腸科就診。肛旁膿腫有肛周膿腫、肛周皮膚大汗腺炎、皮脂腺囊腫伴感染、壞死性筋膜炎、骶前囊腫伴感染，應當加以區分，以免誤診，耽誤治療。
肛周膿腫，是肛門腺體發生感染導致的，肛門腺體開口于肛管齒線處，即肛周膿腫內口，要想根治肛周膿腫，必須處理好內口。
肛周皮膚大汗腺炎，是指肛周皮膚大汗腺感染后在皮內和皮下組織反復發作，廣泛蔓延，形成范圍較廣的慢性炎癥、小膿腫、復雜性竇道和瘺管，它的病變范圍比較廣泛，但是病變位置比較表淺。
肛周壞死性筋膜炎，是肛周皮下淺筋膜和深筋膜發生的感染，以淺筋膜感染多見，病情發展比較迅速，全身癥狀重，死亡率較高，確診后要及時手術，如延誤治療或治療不當，很快導致肛周大面積皮膚筋膜的壞死，并波及陰囊陰莖，蔓延至下腹部，并發氣性壞疽，患者常死于感染性休克或其他并發癥。
肛周皮脂腺囊腫伴感染，皮脂腺囊腫俗稱粉瘤，是由于皮脂腺排泄管受到阻塞，皮脂腺囊狀上皮被逐漸增生的內容物膨脹所形成的滯留性囊腫，它是一種增長緩慢的良性疾病，囊內有白色豆腐渣樣的分泌物，如繼發感染的時可以有疼痛化膿，治療時應該手術切除，應該盡量將囊腫連同包膜完整剝除，如果包膜切除不完整，容易復發。
骶前囊腫伴感染，骶前囊腫是指發生在骶骨和直腸間隙的囊性腫物，臨床上較為少見，但是它的位置比較深，周圍比鄰關系比較復雜，不容易早期發現，容易繼發感染，確診時往往已經進行多次治療，所以外科手術難度比較大。
