病毒性肝炎的治療包括多個方面，保肝抗纖維化、抗病毒、去除病因、預防肝癌等。其中以針對不同病因，并去除病因，治療病毒性肝炎的最重要原則，病毒性肝炎攜帶者需要定期體檢復查，通常不需要治療。保肝治療藥物，治療種類比較多，包括甘草酸鈉技術類制劑。適用于所有慢性肝炎的病人。
抗纖維化治療多為中成藥口服制劑，也適用于所有慢性肝炎的病人，d3注射干擾素，抗病毒治療包括普通干擾素和聚乙二醇化干擾素，是用于慢性乙型肝炎、急慢性丙型肝炎患者。療程至少一年，干擾素聯合利巴韋林是慢性丙型肝炎的標準治療方案。療效取決于丙肝基因分裂以及對治療的應答，一周內出現丙肝病毒低于檢測限者俗稱有快速應答。大部分人群對干擾素治療效果好，痊愈率達87%。
口服和甘類藥物抗病毒治療，藥物用于治療乙型肝炎，包括慢性乙型肝炎和肝硬化患者。在中國大陸有以下四種藥物，拉米夫定、夫唯只替、比夫定、恩替卡韋。國際上還有第五種藥物用于治療，對于上市的藥物耐受的患者，和其他藥物相比的優點是，抗病毒療效好，副作用小，且服用方便，每日一片，在臨床上得到廣泛的應用。免疫抑制劑，抑制劑可以輔助治療肝炎患者。預防腫瘤的發生，降低慢性肝炎發生肝癌的幾率，增加補充微量硒元素。還可注射胸腺肽提高免疫力，停止服用肝損傷藥物也是有很重要意義的。
