高血壓腎病的鑒別最重要的是與腎病引起的高血壓進行鑒別，這兩者到底是誰先引起的誰，這個鑒別也很重要，因為可能涉及到治療方案的不同。
高血壓腎病的往往患者年齡比較大，四十到六十歲左右，而且高血壓在先，一般來說先有高血壓十年左右的時間。而腎炎引起的繼發高血壓，患者的年齡可能偏輕一些，比如二十到三十歲的人容易出現這樣的問題，而且先有腎炎，腎炎在先，之后才發現有高血壓。
患者尿液中的檢查也是不一樣的，高血壓腎病的患者尿蛋白定量一般不超過兩克。而腎炎的病人引起高血壓，這種情況它是腎炎為主，蛋白尿可能可多可少，如果20小時尿蛋白定量超過三克以上，那基本上可以認為是腎炎引起的高血壓。
貧血的程度不一樣，高血壓腎病的患者發生貧血的時間比較晚，而且比較輕。但是如果是腎炎在先，引起高血壓的患者，貧血發生的早，而且重。
另外，還有腎臟以外的一些其他的器官的損害并發癥，高血壓腎病的患者是高血壓引起小動脈硬化它損害到腎臟，它同樣也會傷害到其他的一些靶器官，比如說出現視網膜的問題，出現左心室肥厚，出現冠心病，腦動脈硬化等等。
但是如果是腎炎在先，繼發了高血壓，那這些其他的器官的損害就比較少見了。
如果還不能鑒別的話，那最終就是腎穿刺病理活檢是能夠完全鑒別診斷的，高血壓腎病的患者腎臟的病理表現為良性的腎小動脈硬化，而腎炎的患者會有各種類型的腎小球的病變。
