腦靜脈竇血栓的臨床表現復雜但無特異性，主要為顱內壓增高和皮質受損表現。首發癥狀主要為頭痛，伴嘔吐及視乳頭水腫，伴或不伴有局灶性的神經功能缺損及癲癇發作，也可以視力障礙，肢體無力或精神異常疾病。CVS1的臨床表現與部位有關，各個部位的特點如下：
1、上矢狀竇血栓形成是CVS1最常見的發病部位。呈急性或亞急性的疾病，最主要臨床表現是頭痛、惡心、嘔吐、視乳頭水腫等顱內壓增高的癥狀。
2、海綿竇血栓形成：起病急驟，伴有高熱，眼眶部的疼痛及眶部壓痛，常伴有劇烈的頭痛、惡心和嘔吐，并可出現意識障礙。眼靜脈回流受阻使球結膜水腫，患側眼球突出，眼瞼不能閉合和眼周軟組織紅腫。出現眼瞼下垂，眼球運動受限，眼球固定和事物重影，嘴部以上的面部皮膚感覺減退等。
3、橫竇一乙狀竇血栓形成。
①化膿性的乳突炎和中耳炎引起。主要的癥狀包括：化膿性中耳炎的感染和中毒癥狀，耳后乳突出紅腫熱痛、發熱、寒戰的外周血白細胞增高，頭皮及乳突周圍靜脈怒張。
②腦神經受累癥狀，顱內高壓或局部感染擴散到局部的炎骨質的6對腦神經麻痹，可出現復視；第9對、10對、11對腦神經擴張的靜脈壓迫，而出現頸靜脈孔綜合癥。
③顱內高壓癥狀：頭痛、嘔吐、視乳頭水腫等嚴重，出現昏迷和癲癇發作。
