乙肝的藥物治療比較復雜，需要根據患者具體情況進行判斷，所以建議乙肝患者治療到當地正規醫院的感染性疾病科，在醫生指導下進行個性化治療，如果患者年紀較輕，沒有明顯的肝纖維化、肝硬化、肝功能正常，這種情況定期復查即可，不需要口服藥物，如果口服藥物反而可能打破目前的免疫平衡狀態，出現肝功異常，如果肝功能反復異常，排除酒精肝、脂肪肝、藥物肝等其他原因導致的肝損害以后，就需要考慮保肝抗病毒藥物治療，
抗病毒治療又分為兩類，干擾素和口服核苷類藥物，干擾素同時又分為短效和長效，干擾素有優點和缺點，優點是療程相對固定，一般十二月左右，有些延長可能到一年半，如果干擾素有效，療效持久，停藥后反彈率低，不用于發生病毒性耐藥，但缺點是療效相對較低，藥品需要冷凍保存，注射治療，所以應用不是很方便，同時的干擾素用藥初期可能出現不良反應較多，比如發熱、骨髓抑制、自身免疫性疾病，對于失代償期肝硬化也是不建議使用的，
而口服核苷類似物，優點是抗病毒能力較高，口服給藥比較方便，依從性較高，對于肝硬化失代償期患者也可以使用，缺點是療程不固定，療程較長，一般三到五年，最長可以終生服藥，停藥以后容易反彈，長期口服還可能出現藥物的耐藥，所以要根據患者的具體情況綜合判斷選擇合適的藥物進行治療。
