血尿的病因有如下幾方面：
一、泌尿系統的疾病，包括炎癥，主要為原發和繼發的免疫反應性炎癥，如原發性腎小球腎炎、iga腎病、過敏性紫癜性腎炎、狼瘡性腎炎等。
二、感染，包括普通的細菌、支原體、衣原體、結核菌等病原微生物所導致的腎盂腎炎、膀胱炎等，結石包括腎結石、輸尿管結石、膀胱結石等等，腫瘤如腎癌、膀胱癌、前列腺腫瘤也可以出現血尿，血管病有腎動脈、腎靜脈、腎內微血管血栓和栓塞也可以出現，遺傳性先天性的泌尿系統疾病如多囊腫、多囊腎、腎囊腫等可以出現血尿，泌尿系統的外傷和機械操作如導尿、膀胱鏡檢查，外傷等可以出現血尿，全身性疾病包括感染性疾病如流行性出血熱、猩紅熱、鉤端螺旋體敗血癥，血液系統疾病如血小板減少性紫癜、再生障礙性貧血、白血病等免疫和自身免疫性疾病如急性風濕熱、系統性紅斑狼瘡、過敏性紫癜等，心血管疾病如血管炎、充血性心力衰竭、亞急性心內膜炎等，內分泌代謝疾病如痛風、糖尿病腎病、甲狀旁腺功能亢進癥等疾病可以出現血尿。
三、尿路鄰近器官的疾病，如急性和慢性盆腔炎、急性闌尾炎、前列腺炎，嚴重惡性腫瘤如宮頸癌、結腸癌，及其他疾病清潔和刺激尿路時也可以產生血尿。
四、化學物品或者藥品對尿路的損害，如吲哚美辛、甘露醇、汞、鉛等重金屬對中腎小管的損害，環璘酰胺引起的出血性膀胱炎、肝素過量也可以出現血尿。
五、功能性血尿，平時運動量小的健康人突然加大運動量也可以出現運動性血尿。
