經食道超聲檢查整體安全性較高，但作為一種侵入性檢查手段，仍存在一定潛在風險，風險程度與患者個體狀況、操作規范程度等因素密切相關。
其一，麻醉相關風險。檢查前需使用局部麻醉劑，部分患者可能對麻醉劑過敏，出現皮疹、呼吸困難等過敏反應；極少數情況下，麻醉劑可能抑制呼吸中樞，導致呼吸抑制，尤其是老年患者或呼吸功能不全者風險更高。其二，食道損傷風險。檢查過程中，超聲探頭需經口腔插入食道，操作不當可能劃傷食道黏膜，引發出血、疼痛，嚴重者可能造成食道穿孔。其三，心血管系統風險。檢查時探頭刺激食道，可能誘發心律失常，如早搏、心動過速等；對于有嚴重心臟基礎疾病的患者，還可能加重心臟負擔，誘發心絞痛、心肌梗死等。其四，誤吸風險。檢查過程中患者若出現嘔吐，胃內容物可能誤吸入氣管，導致吸入性肺炎，尤其是意識不清或吞咽功能障礙者風險更大。其五，感染風險。若檢查器械消毒不徹底，可能引發醫源性感染，如食道感染、心臟感染等。
盡管經食道超聲檢查存在上述潛在風險，但通過嚴格掌握適應證、規范操作流程、加強術前評估與準備、術后密切觀察等措施，可有效降低風險發生率。若醫生建議進行經食道超聲檢查，患者應積極配合，如實告知自身病史、過敏史等信息，檢查后遵循醫囑，如有不適及時就醫。
