核酸檢測的方法是指鼻拭子、咽拭子、取分泌物、取糞便、抽血檢測等，核酸檢測可以根據具體是何系統發生的感染來決定。一般上呼吸道感染鼻拭子檢測、咽拭子檢測都很準確，下呼吸道感染取下呼吸道分泌物檢測，消化道感染可做肛拭子核酸檢測，血液傳播性疾病取血標本做核酸檢測，所以目前沒有最準確的核酸檢測方法，一切依情況而定。
1、上呼吸道感染：發生上呼吸道感染，比如流感、新型冠狀病毒感染，可以做呼吸道分泌物的檢測，最常用的是咽拭子，通?？谘适米踊虮茄适米訌目谇徊杉驈谋乔徊杉屎聿课坏纳掀ぜ毎?，檢測細胞內是否有核酸或該部位的呼吸道分泌物，檢測有沒有新型冠狀病毒核酸或流感核酸。
2、下呼吸道感染：對于重癥病例還有可能采集下呼吸道的分泌物，比如深度誘導排痰或進行氣管鏡、取肺泡灌洗液做核酸檢測。
3、消化道感染：部分新型冠狀病毒肺炎患者表現為消化道癥狀，如嘔吐、腹瀉等可以做糞便的核酸檢測，也可以做肛拭子的核酸檢測，比如輪狀病毒感染或諾如病毒感染通常取糞便或肛拭子。
4、血液傳播疾?。罕热缫腋?、丙肝、艾滋病等一般是取血標本做核酸檢測，一方面是評估病毒是否在復制，另一方面是用于評估治療效果，如果進行抗病毒治療后核酸的定量越來越低，一直到檢測不到說明治療有效。
核酸檢測選擇何種方式取決經何途徑傳播，取決于在何系統發生繁殖、復制，所以要根據不同的情況選擇合適的檢測方式。
