乙肝小三陽可以通過一般治療、應用抗病毒藥物、應用護肝藥物、應用抗纖維化藥物、手術等方式治療，患者一旦有不適癥狀，建議及時就醫。
1、一般治療：
乙肝小三陽通常說明病毒復制不活躍，但是仍然具有傳染性，患者也容易出現肝功能受損，主要表現為食欲減退、全身乏力等。平時應避免與他人共用私人物品，比如浴巾、毛巾、剃須刀等。平時要保持健康均衡的飲食，不可以暴飲暴食，要控制糖分與脂肪的攝入，良好的生活習慣有利于身體恢復。
2、應用抗病毒藥物：
患病后也需要遵醫囑應用拉米夫定片、恩替卡韋片、富馬酸替諾福韋二吡呋酯片等藥物治療，上述藥物既可以在餐前吃，也可以在餐后吃，通常能夠對乙型肝炎病毒起到抑制與殺滅作用，有利于緩解臨床癥狀。
3、應用護肝藥物：
乙肝小三陽患者容易出現肝臟損傷，因此可以遵醫囑應用護肝片、多烯磷脂酰膽堿膠囊、谷胱甘肽片等藥物治療，上述藥物通常可以用35~38℃的溫水送服，規范用藥通常可以促進受損的肝細胞恢復。
4、應用抗纖維化藥物：
患者也可以遵醫囑應用扶正化瘀膠囊、安絡化纖丸、復方鱉甲軟肝片等藥物進行治療，規范用藥，一般能夠發揮抗纖維化的效果，用藥期間應避免飲用濃茶、咖啡以及含有酒精的飲品，以免降低藥效。
5、手術：
如果乙肝小三陽患者通過保守方式治療無效，可以在醫生操作下通過肝臟移植術進行治療。術后建議每天用醫用碘伏或醫用酒精，對傷口部位進行消毒處理，這樣做能夠預防傷口感染。
患者在恢復期間也需要遵醫囑定期去醫院復查，以便監測病情變化。
