癲癇都是有病因的，但是有些癲癇，人類已經知道了，但是有些癲癇那是在正在探索中，因此已知的有病因的癲癇為繼發性癲癇，而未知病因的癲癇為特發性癲癇，也就是原發性癲癇。
臨床表現為繼發性癲癇，但是尚不能明確病因者為原發性癲癇，那么繼發性癲癇主要是的病因，主要有:
第一個是皮質發育障礙。
第二個是腫瘤，顱內腫瘤可以直接引起癲癇發作，顱外腫瘤則可以通過轉移或者副腫瘤綜合征成為癲癇反復發作的病因。
第三的是頭部的外傷，頭傷上后一周內出現的癲癇發作稱為早發現癲癇，頭傷以后癲癇主要是指頭傷一周以后出現的癲癇發作，腦部手術也可以導致癲癇的發作，嬰幼兒頭傷癲癇常與產傷有關，頭傷后癲癇是一種惡性癲癇，一旦發生病程往往持續十年以上。
第四個最主要的原因是中樞神經系統感染，中樞神經系統感染是癲癇最常見的病因之一，比如結核性腦膜炎神經梅毒病毒性腦炎，都是繼發性癲癇最為常見的病因，再一個是腦血管病腦血管病引起的癲癇，主要是指腦血管病發病兩周以后出現的癲癇發作，這種類型的癲癇在腦血管進入恢復期后出現反復發作的機會大于80%是癲癇常見的原因之一。
另外一個是寄生蟲感染，比如腦型腦型肺吸蟲病，血吸蟲，北方的豬囊蟲都可引起癲癇發作，遺傳性代謝性疾病，許多遺傳代謝性疾病可以引起癲癇發作，比如腦內表皮囊腫等等，還有神經變性疾病，比如運動神經元病帕金森病的晚都會出現癲癇發作，再一個是繼發性腦病，比如缺血缺氧性腦病都可以引起其它的原因，比如糖尿病可以引起癲癇，系統有紅斑狼瘡患者也可以引起癲癇。
