腳長跖疣可以用水楊酸軟膏、氟尿嘧啶軟膏、咪喹莫特乳膏、重組人干擾素α2b凝膠、維A酸乳膏等藥膏，應用這些藥膏時都需要遵醫囑。
1、水楊酸軟膏：
腳長跖疣主要是由人乳頭瘤病毒感染引起的，可以在醫生的指導下使用水楊酸軟膏治療，該藥物可以通過促進皮損剝脫，起到治療的作用。
2、氟尿嘧啶軟膏：
該藥物能夠抑制胸腺嘧啶核苷酸合成酶，阻斷脫氧嘧啶核苷酸轉換成胸腺嘧啶核苷酸，干擾DNA合成，在臨床上可用于角化過度、疣狀損害及白色斑塊的治療，所以腳上長跖疣也可以使用此藥物治療。
3、咪喹莫特乳膏：
該藥物能夠在用藥局部誘生多種細胞因子及相關產物，從而產生免疫調節和間接抗病毒的作用，可用于成人外生殖器和肛周尖銳濕疣的治療，對于跖疣也可以起到一定的治療作用。
4、重組人干擾素α2b凝膠：
屬于抗病毒藥，具有廣譜抗病毒的作用，可用于尖銳濕疣、帶狀皰疹、口唇皰疹、生殖器皰疹以及跖疣等的治療。
5、維A酸乳膏：
屬于角質溶解劑，能夠使角質層細胞黏合疏松，使用該藥物治療跖疣，有助于促進皮損脫落。
在應用以上藥膏前需要注意，如果對于其中的成分過敏應禁止使用，兒童需要在成人監護下使用，使用后如果出現了不良反應，應立即前往醫院就醫。
