感染性結腸炎可以通過口服抗生素藥物、使用糖皮質激素類藥物、應用氨基水楊酸制劑、對癥治療、手術等方式治療。
1、口服抗生素藥物：
感染性結腸炎如果是由細菌感染引起的，可以在醫生的指導下口服喹諾酮類抗生素類的藥物進行治療，比如鹽酸環丙沙星片、氧氟沙星片、諾氟沙星片等。如果是感染原蟲引起的，可以服用硝基咪唑類抗生素類的藥物治療，比如甲硝唑片、替硝唑片、奧硝唑片等。
2、使用糖皮質激素類藥物：
中度及重度感染性結腸炎的患者，在病情急性活動期，也可以遵醫囑使用醋酸潑尼松片、注射用甲潑尼龍琥珀酸鈉、氫化可的松注射液等藥物治療。
3、應用氨基水楊酸制劑：
比如美沙拉秦腸溶片、奧沙拉秦鈉膠囊、柳氮磺吡啶腸溶片等，是治療感染性結腸炎的主要藥物。
4、對癥治療：
患有感染性結腸炎時，可能會導致患者出現便血，因便血導致失血可能會引起貧血的情況，可以在醫生的指導下進行輸血治療。如果引起了低蛋白血癥，也可以靜脈滴注人血白蛋白治療。對于腹痛、腹瀉的患者可以使用硫酸阿托品片、顛茄片、蒙脫石散等藥物進行治療。
5、手術：
感染性結腸炎通常無需手術治療，但如果合并了腸梗阻、腸穿孔、腸壞死等嚴重的并發癥時，應及時在醫生的操作下通過回腸貯袋-肛管吻合術進行治療，以防結腸喪失正常的生理功能、危害生命健康。
治療期間應合理飲食，保持良好的心態，嚴格遵醫囑按時用藥，有利于促進身體康復。
