神經官能癥作為臨床中的一大類疾病，包括了焦慮障礙，恐懼癥，疑病癥，軀體形式障礙等等，在臨床當中對于神經官能癥的確診，主要從以下幾個方面：
一，詳細采集病史，主要詢問患者本人相關的疾病的發病情況，例如疾病發病的內容，有什么癥狀的特點，當時發病時的背景是什么，當然也會更詳細地采集發病的年齡，軀體心理社會因素，發作時的臨床表現，包括起病的緩急，最突出的癥狀，自主神經功能癥狀，疼痛癥狀，睡眠飲食以及癥狀對患者的影響等等。還會做排除的信息采集，例如有沒有絕望、悲觀、自殺等抑郁癥狀等等。病程的特點，包括過去的病史的情況以及過去治療的情況，個人史和家族史。
二，采集體格檢查和輔助檢查，主要目的就是為了排除軀體疾病，可能需要做相關的排除軀體疾病的檢查，例如心電圖，腎上腺功能檢測，甲狀腺功能檢測等等。
三，精神檢查，這是確診神經官能癥非常重要的一部分，主要是來采集患者精神病性癥狀，包括知情意的相關內容，例如神經官能癥的患者是不是存在焦慮、恐懼、強迫，以及主觀體驗嚴重程度等等。包括自主神經功能亢進的癥狀，比如心慌，胸悶，氣促，顫抖，大汗等等。
四，量表評估，主要是為了針對于神經官能癥相關疾病的相關量表測定，例如普遍的焦慮水平的量表，漢密爾頓焦慮量表，例如評定特定焦慮癥狀的量表，像社交回避和苦惱量表，以及驚恐相關癥狀量表，驚恐障礙嚴重程度量表等等。
