房顫的手術過程主要是指射頻消融手術的過程。射頻消融手術和電生理檢查是在同時進行的，它是在有特殊設備的手術間進行，也就是在導管室內進行。醫務人員是將各種監測裝置與患者的身體連接，將患者的身體用無菌單蓋住，醫務人員穿戴上無菌手術衣和手套。
首先，導管插入到腹股溝，手臂或者是肩膀或者是鎖骨下這個部位的皮膚進行消毒，局麻藥進行局部麻醉，然后用穿刺針穿刺靜脈或者是動脈血管，電生理檢查導管先通過血管插入到心腔當中，心臟電生理檢查所用的電極導管長而可彎的這種導管，它可以將電信號傳入和傳出心臟。
電極導管記錄心臟不同部位的電活動，并且可以發出微弱的電刺激來刺激心臟，以便誘發心律失常，明確房顫的診斷和發作的部位，然后再通過導管找到心臟異常電活動的確切部位，通過消融儀發送射頻電流消融治療，從而根治房顫。
整個過程患者一般是處于清醒的狀態，有時會用鎮靜劑來緩解患者的緊張，患者可以全程的監護。電生理檢查一般不會引起任何的疼痛，導管在進行血管和心腔的過程當中，患者一般不會有感覺，檢查的時候可以有微弱的電流刺激心臟，患者不會感覺到這些電脈沖，往往會誘發出心動過速，感覺發作和以前發作有相同的情況，這些操作風險相對還是比較小的，安全性比較高。
